Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phactr4Q501J7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phactr4Q501J7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phactr4Q501J7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phactr4Q501J7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms