Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Nxf2Q4ZGD8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Nxf2Q4ZGD8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Nxf2Q4ZGD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Nxf2Q4ZGD8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Nxf2Q4ZGD8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Nxf2Q4ZGD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Nxf2Q4ZGD8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Nxf2Q4ZGD8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms