Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc84Q4VA36 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc84Q4VA36 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,92
Ccdc84Q4VA36 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc84Q4VA36 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ccdc84Q4VA36 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26,89■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ccdc84Q4VA36 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Ccdc84Q4VA36 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc84Q4VA36 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms