Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc185Q3V118 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc185Q3V118 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc185Q3V118 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc185Q3V118 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms