Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim15Q3UTD9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms