Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pde4cQ3UEI1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Pde4cQ3UEI1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pde4cQ3UEI1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pde4cQ3UEI1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pde4cQ3UEI1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pde4cQ3UEI1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pde4cQ3UEI1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms