Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxi2Q3I5G5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms