Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim71Q1PSW8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim71Q1PSW8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim71Q1PSW8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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