Protein–RNA interactions for Protein: Q149R9

Lpar5, Lysophosphatidic acid receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpar5Q149R9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lpar5Q149R9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lpar5Q149R9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lpar5Q149R9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lpar5Q149R9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lpar5Q149R9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lpar5Q149R9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpar5Q149R9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lpar5Q149R9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpar5Q149R9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lpar5Q149R9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lpar5Q149R9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lpar5Q149R9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms