Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spata18Q0P557 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Spata18Q0P557 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spata18Q0P557 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Spata18Q0P557 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Spata18Q0P557 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27,56■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27,56■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27,56■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Spata18Q0P557 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Spata18Q0P557 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms