Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col9a1Q05722 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col9a1Q05722 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a1Q05722 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a1Q05722 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms