Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frat1P70339 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frat1P70339 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frat1P70339 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frat1P70339 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frat1P70339 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frat1P70339 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frat1P70339 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frat1P70339 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frat1P70339 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frat1P70339 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frat1P70339 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frat1P70339 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frat1P70339 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frat1P70339 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms