Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf6P70279 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf6P70279 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Surf6P70279 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf6P70279 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf6P70279 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf6P70279 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Surf6P70279 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf6P70279 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf6P70279 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Surf6P70279 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms