Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NfixP70257 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NfixP70257 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NfixP70257 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NfixP70257 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NfixP70257 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NfixP70257 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NfixP70257 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NfixP70257 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NfixP70257 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NfixP70257 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NfixP70257 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NfixP70257 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NfixP70257 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NfixP70257 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NfixP70257 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NfixP70257 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NfixP70257 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NfixP70257 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NfixP70257 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NfixP70257 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NfixP70257 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NfixP70257 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NfixP70257 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NfixP70257 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NfixP70257 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NfixP70257 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NfixP70257 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NfixP70257 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NfixP70257 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NfixP70257 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NfixP70257 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NfixP70257 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NfixP70257 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NfixP70257 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NfixP70257 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NfixP70257 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NfixP70257 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NfixP70257 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NfixP70257 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NfixP70257 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NfixP70257 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NfixP70257 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NfixP70257 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NfixP70257 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NfixP70257 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NfixP70257 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NfixP70257 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NfixP70257 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NfixP70257 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NfixP70257 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NfixP70257 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NfixP70257 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NfixP70257 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NfixP70257 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NfixP70257 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NfixP70257 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NfixP70257 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NfixP70257 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NfixP70257 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NfixP70257 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NfixP70257 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NfixP70257 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NfixP70257 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NfixP70257 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NfixP70257 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NfixP70257 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NfixP70257 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NfixP70257 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NfixP70257 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NfixP70257 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NfixP70257 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NfixP70257 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NfixP70257 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NfixP70257 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NfixP70257 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NfixP70257 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NfixP70257 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NfixP70257 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NfixP70257 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NfixP70257 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NfixP70257 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NfixP70257 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NfixP70257 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NfixP70257 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NfixP70257 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NfixP70257 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NfixP70257 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NfixP70257 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NfixP70257 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NfixP70257 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NfixP70257 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NfixP70257 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NfixP70257 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NfixP70257 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NfixP70257 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NfixP70257 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NfixP70257 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NfixP70257 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NfixP70257 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
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