Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf6P70196 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf6P70196 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf6P70196 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf6P70196 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf6P70196 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf6P70196 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf6P70196 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf6P70196 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf6P70196 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf6P70196 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf6P70196 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf6P70196 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf6P70196 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms