Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl23aP62751 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl23aP62751 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl23aP62751 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms