Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Cux1P53564 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Cux1P53564 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Cux1P53564 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37,12■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,11■■■■□ 3,53
Cux1P53564 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37,11■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37,08■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37,08■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,53
Cux1P53564 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37,03■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37,01■■■■□ 3,52
Cux1P53564 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3,51
Cux1P53564 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36,99■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36,99■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Cux1P53564 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36,95■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,5
Cux1P53564 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36,93■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36,92■■■■□ 3,5
Cux1P53564 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36,91■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36,91■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Cux1P53564 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,89■■■■□ 3,5
Cux1P53564 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Cux1P53564 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Cux1P53564 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Cux1P53564 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Cux1P53564 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Cux1P53564 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36,76■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Cux1P53564 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,5 ms