Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upp1P52624 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upp1P52624 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upp1P52624 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upp1P52624 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Upp1P52624 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Upp1P52624 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upp1P52624 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upp1P52624 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upp1P52624 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upp1P52624 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upp1P52624 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Upp1P52624 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms