Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdkn1cP49919 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdkn1cP49919 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdkn1cP49919 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms