Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VegfbP49766 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VegfbP49766 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VegfbP49766 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VegfbP49766 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VegfbP49766 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VegfbP49766 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VegfbP49766 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VegfbP49766 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VegfbP49766 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VegfbP49766 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VegfbP49766 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VegfbP49766 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VegfbP49766 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VegfbP49766 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VegfbP49766 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VegfbP49766 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VegfbP49766 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VegfbP49766 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VegfbP49766 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VegfbP49766 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VegfbP49766 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VegfbP49766 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VegfbP49766 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms