Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbp3P49194 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbp3P49194 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbp3P49194 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbp3P49194 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbp3P49194 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms