Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox8bP48772 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox8bP48772 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms