Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp12P34960 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp12P34960 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp12P34960 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms