Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ChgaP26339 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ChgaP26339 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ChgaP26339 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChgaP26339 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ChgaP26339 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ChgaP26339 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ChgaP26339 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ChgaP26339 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ChgaP26339 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ChgaP26339 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ChgaP26339 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ChgaP26339 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ChgaP26339 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ChgaP26339 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ChgaP26339 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ChgaP26339 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ChgaP26339 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ChgaP26339 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ChgaP26339 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ChgaP26339 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms