Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bmp4P21275 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bmp4P21275 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bmp4P21275 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bmp4P21275 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmp4P21275 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bmp4P21275 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bmp4P21275 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp4P21275 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms