Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VimP20152 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VimP20152 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VimP20152 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VimP20152 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VimP20152 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VimP20152 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VimP20152 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VimP20152 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VimP20152 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VimP20152 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VimP20152 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VimP20152 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VimP20152 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VimP20152 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VimP20152 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VimP20152 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VimP20152 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VimP20152 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VimP20152 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VimP20152 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VimP20152 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VimP20152 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VimP20152 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VimP20152 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VimP20152 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VimP20152 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VimP20152 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VimP20152 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VimP20152 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VimP20152 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VimP20152 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VimP20152 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VimP20152 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VimP20152 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VimP20152 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VimP20152 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VimP20152 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VimP20152 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VimP20152 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VimP20152 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VimP20152 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VimP20152 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VimP20152 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VimP20152 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VimP20152 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VimP20152 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VimP20152 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VimP20152 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VimP20152 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VimP20152 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VimP20152 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VimP20152 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VimP20152 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VimP20152 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VimP20152 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VimP20152 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VimP20152 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VimP20152 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VimP20152 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VimP20152 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VimP20152 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VimP20152 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VimP20152 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VimP20152 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VimP20152 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VimP20152 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VimP20152 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VimP20152 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VimP20152 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VimP20152 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VimP20152 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VimP20152 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VimP20152 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VimP20152 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VimP20152 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VimP20152 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VimP20152 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VimP20152 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VimP20152 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VimP20152 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VimP20152 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VimP20152 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VimP20152 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms