Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd5P13379 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd5P13379 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd5P13379 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd5P13379 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd5P13379 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd5P13379 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd5P13379 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd5P13379 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd5P13379 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd5P13379 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd5P13379 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd5P13379 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd5P13379 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd5P13379 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1276.2 ms