Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RaraP11416 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RaraP11416 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RaraP11416 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RaraP11416 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RaraP11416 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RaraP11416 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RaraP11416 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RaraP11416 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RaraP11416 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RaraP11416 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RaraP11416 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RaraP11416 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RaraP11416 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RaraP11416 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RaraP11416 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RaraP11416 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RaraP11416 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RaraP11416 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RaraP11416 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RaraP11416 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RaraP11416 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RaraP11416 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RaraP11416 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RaraP11416 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RaraP11416 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RaraP11416 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RaraP11416 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RaraP11416 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RaraP11416 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RaraP11416 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RaraP11416 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RaraP11416 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RaraP11416 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RaraP11416 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RaraP11416 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RaraP11416 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RaraP11416 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RaraP11416 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RaraP11416 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RaraP11416 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RaraP11416 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RaraP11416 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RaraP11416 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RaraP11416 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RaraP11416 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RaraP11416 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RaraP11416 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RaraP11416 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RaraP11416 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RaraP11416 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RaraP11416 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RaraP11416 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RaraP11416 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RaraP11416 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RaraP11416 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RaraP11416 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RaraP11416 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RaraP11416 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RaraP11416 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RaraP11416 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RaraP11416 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RaraP11416 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RaraP11416 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RaraP11416 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RaraP11416 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RaraP11416 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RaraP11416 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RaraP11416 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RaraP11416 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RaraP11416 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RaraP11416 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RaraP11416 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RaraP11416 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RaraP11416 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RaraP11416 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RaraP11416 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RaraP11416 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RaraP11416 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RaraP11416 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RaraP11416 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RaraP11416 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RaraP11416 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RaraP11416 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RaraP11416 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RaraP11416 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RaraP11416 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RaraP11416 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RaraP11416 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RaraP11416 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RaraP11416 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RaraP11416 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RaraP11416 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RaraP11416 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RaraP11416 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RaraP11416 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RaraP11416 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RaraP11416 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RaraP11416 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RaraP11416 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms