Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Eb1P04230 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Eb1P04230 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-Eb1P04230 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Eb1P04230 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms