Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme6O88425 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme6O88425 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme6O88425 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme6O88425 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme6O88425 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme6O88425 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme6O88425 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme6O88425 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme6O88425 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme6O88425 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme6O88425 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme6O88425 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms