Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx3O70492 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx3O70492 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx3O70492 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx3O70492 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx3O70492 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx3O70492 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx3O70492 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx3O70492 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx3O70492 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx3O70492 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx3O70492 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx3O70492 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx3O70492 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx3O70492 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms