Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx3O55144 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx3O55144 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlx3O55144 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms