Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5r2O35926 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdk5r2O35926 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r2O35926 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms