Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smad6O35182 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad6O35182 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad6O35182 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad6O35182 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad6O35182 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad6O35182 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smad6O35182 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad6O35182 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad6O35182 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad6O35182 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad6O35182 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad6O35182 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad6O35182 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad6O35182 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad6O35182 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad6O35182 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad6O35182 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad6O35182 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad6O35182 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms