Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfip1G5E8V9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfip1G5E8V9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfip1G5E8V9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfip1G5E8V9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfip1G5E8V9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfip1G5E8V9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfip1G5E8V9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip1G5E8V9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arfip1G5E8V9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arfip1G5E8V9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1069.4 ms