Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nccrp1G3X9C2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nccrp1G3X9C2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nccrp1G3X9C2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nccrp1G3X9C2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms