Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
2610008E11RikG3X964 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
2610008E11RikG3X964 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
2610008E11RikG3X964 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
2610008E11RikG3X964 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
2610008E11RikG3X964 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
2610008E11RikG3X964 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
2610008E11RikG3X964 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
2610008E11RikG3X964 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
2610008E11RikG3X964 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
2610008E11RikG3X964 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
2610008E11RikG3X964 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
2610008E11RikG3X964 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
2610008E11RikG3X964 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms