Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NpcdF8VQB8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NpcdF8VQB8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NpcdF8VQB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NpcdF8VQB8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NpcdF8VQB8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms