Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LctF8VPT3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LctF8VPT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LctF8VPT3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LctF8VPT3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LctF8VPT3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LctF8VPT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms