Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Crocc2F6XLV1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Crocc2F6XLV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Crocc2F6XLV1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Crocc2F6XLV1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Crocc2F6XLV1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Crocc2F6XLV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Crocc2F6XLV1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Crocc2F6XLV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Crocc2F6XLV1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Crocc2F6XLV1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Crocc2F6XLV1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Crocc2F6XLV1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Crocc2F6XLV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Crocc2F6XLV1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Crocc2F6XLV1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Crocc2F6XLV1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Crocc2F6XLV1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 415.6 ms