Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn1r68E9Q0V3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r68E9Q0V3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r68E9Q0V3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r68E9Q0V3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms