Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl3lE9PWZ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpl3lE9PWZ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl3lE9PWZ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl3lE9PWZ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl3lE9PWZ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms