Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm8994E9PV04 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm8994E9PV04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm8994E9PV04 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm8994E9PV04 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8994E9PV04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8994E9PV04 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8994E9PV04 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8994E9PV04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8994E9PV04 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms