Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phactr2B1AVP0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phactr2B1AVP0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Phactr2B1AVP0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Phactr2B1AVP0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phactr2B1AVP0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Phactr2B1AVP0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phactr2B1AVP0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phactr2B1AVP0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phactr2B1AVP0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phactr2B1AVP0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phactr2B1AVP0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phactr2B1AVP0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms