Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms