Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramef17A2ASJ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramef17A2ASJ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramef17A2ASJ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramef17A2ASJ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef17A2ASJ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms