Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SetxA2AKX3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SetxA2AKX3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SetxA2AKX3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SetxA2AKX3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SetxA2AKX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms