Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm13941A2AJ38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm13941A2AJ38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm13941A2AJ38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm13941A2AJ38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13941A2AJ38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm13941A2AJ38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm13941A2AJ38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm13941A2AJ38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms