Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc112A0AUP1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc112A0AUP1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc112A0AUP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc112A0AUP1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc112A0AUP1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc112A0AUP1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms