Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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